【行業(yè)新聞】使用MassARRAY對NSCLC中體細胞突變進行高度敏感的評估
近日，Agena Bioscience宣布在PLOS ONE發(fā)表了一項比較研究，強調(diào)使用其基于質(zhì)譜平臺和新的高度靈敏的iPLEX?HS化學(xué)物質(zhì)檢測發(fā)生在非小細胞肺癌（NSCLC）EGFR、KRAS、BRAF和NRAS的體細胞突變。
肺癌通常使用微創(chuàng)技術(shù)進行活檢，如薄針狀活檢和細胞學(xué)細胞塊，其導(dǎo)致具有最小腫瘤組織的小的異質(zhì)樣品標本。大多數(shù)技術(shù)如Sanger測序和NGS需要至少20-40％的腫瘤含量來檢測低至5％-20％變異等位基因頻率（VAF）的突變。因此，由于腫瘤含量不足，使樣品不合格。
該研究證明，使用Agena Bioscience的iPLEX HS Lung Panel測試來自醫(yī)學(xué)基金會的179個存檔NSCLC臨床標本，具有1％的VAF檢測限和僅5-10ng的輸入DNA。已經(jīng)使用Agena Bioscience的OncoFOCUS?v2.0或v3.0面板在MassARRAY系統(tǒng)上測試了EGFR，KRAS，NRAS和BRAF的突變標本，具有5-10％VAF的檢測限。鑒于iPLEX HS化學(xué)物質(zhì)的敏感性增加，鑒定到先前未檢測到的KRAS，NRAS，BRAF和EGFR的另外17個突變（或9.5％以上的突變）。這些額外的突變主要在核心針活檢和細胞學(xué)細胞塊中檢測到。
iPLEX?HS Lung Panel在MassARRAY系統(tǒng)上運行，使用擴增和單堿基擴增，隨后在質(zhì)譜儀上進行分析。根據(jù)樣品中的野生型信號，延伸反應(yīng)中消耗野生型終止子，并將突變信號的量化終止至非常低的等位基因頻率，可以實現(xiàn)更高的靈敏度。
Agena Bioscience科學(xué)事務(wù)高級總監(jiān)Darryl Irwin博士說：“iPLEX HS Lung面板的檢測限度和DNA輸入要求不斷增加，成為用于檢測腫瘤含量有限的NSCLC標本的理想選擇?！?/p>
醫(yī)學(xué)基金會表示，“此外，由于8小時的周轉(zhuǎn)時間和每個樣本成本低，我們可以對具有較高檢測水平的更多樣本進行目標篩選，從而潛在地在早期階段發(fā)現(xiàn)突變。”
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